Entrer les méthodes d'analyse
Meilleures pratiques pour rendre compte des méthodes analytiques
Introduction
Ce guide détaille la manière dont les intendants des données doivent indiquer les méthodes analytiques lorsqu'ils téléversent des données sur DataStream, afin de favoriser une approche cohérente dans l'ensemble des jeux de données. Ces renseignements sont essentiels pour l’interprétation et la réutilisation des données. Cela permet aussi aux utilisateurs secondaires de déterminer si les données sont comparables d’un jeu de données à l’autre. Plus il y a de renseignements, mieux c’est.
DataStream exige que les méthodes analytiques soient indiquées pour les échantillons analysés en laboratoire. Les rapports sur les données fournis par les laboratoires commerciaux incluent généralement de l’information sur les méthodes analytiques utilisées pour produire les résultats. Les intendants des données peuvent aussi fournir de l’information sur la manière dont les données ont été collectées sur le terrain (par exemple, le nom de la marque et le modèle de l’équipement).
Le schéma de données de DataStream s’harmonise au format de données élaboré par l’Environmental Protection Agency des États-Unis et le U.S. Geological Survey des États-Unis.
Pour plus de détails sur la manière de choisir les métadonnées de caractéristiques exactes, voir:
Format des données
Les méthodes analytiques doivent être signalées au moyen des champs ResultAnalyticalMethodID, ResultAnalyticalMethodContext, et ResultAnalyticalMethodName (Tableau 1).
DataStream exige que tous les échantillons analysés en laboratoire incluent :
- À la fois ResultAnalyticalMethodContext et ResultAnalyticalMethodID, OU
- ResultAnalyticalMethodName, OU
- Les trois
Le nom du laboratoire doit être indiqué dans le champ LaboratoryName.
Tableau 1 : Champs DataStream utilisés pour rendre compte des méthodes analytiques.
Nom du champ | Description | Exemple |
---|---|---|
ResultAnalyticalMethodID | Code d’identification attribué par le diffuseur de la méthode analytique. | 200.8 |
ResultAnalyticalMethodContext | Diffuseur du code d’identification de la méthode. Obligatoire si l’identifiantest rempli. Pour plus détails, voir le Tableau 4. | USEPA |
ResultAnalyticalMethodName | Nom du procédé analytique utilisé par le laboratoire. | Détermination des oligo-éléments dans les eaux et les déchets par spectrométrie de masse à plasma inductif |
LaboratoryName | Nom du laboratoire responsable du résultat. |
Méthodes normalisées établies
Si des méthodes analytiques normalisées ont été utilisées, le diffuseur de la méthode (par exemple, « USEPA », « VMV », « APHA ») doit être saisi dans le champ ResultAnalyticalMethodContext (« Context »), et le code de la méthode (par exemple, « 200.8 ») doit être indiqué dans le champ ResultAnalyticalMethodID (Tableau 2). Vous trouverez une liste des valeurs autorisées pour les diffuseurs de méthode qui peuvent être saisies dans la colonne ResultAnalyticalMethodContext dans le Tableau 4, ou dans le Modèle de téléchargement de DataStreamà l’onglet Valeurs autorisées.
Tableau 2 : Format des rapports sur les méthodes normalisées établies
ResultAnalytical MethodID | ResultAnalytical MethodContext | ResultAnalytical MethodName | LaboratoryName |
---|---|---|---|
200.8 | USEPA | Détermination des oligo-éléments dans les eaux et les déchets par spectrométrie de masse à plasma inductif | [nom du laboratoire] |
Méthodes propriétaires
Si un laboratoire commercial a utilisé une méthode personnalisée ou élaborée à l’interne, ResultAnalyticalMethodContext doit être « PROPRIETARY », le code de la méthode du laboratoire étant indiqué pour ResultAnalyticalMethodID. Cependant, si les méthodes utilisées sont considérées comme équivalentes aux méthodes normalisées établies (par exemple, USEPA, APHA, etc.), les codes des méthodes normalisées doivent être utilisés à la place des codes des laboratoires propriétaires. Cela permet d’améliorer la cohérence dans les rapports de méthodes et de faciliter l’utilisation des données pour les utilisateurs secondaires des données.
Méthodes décrites dans une publication scientifique
Si la méthodologie provient d’un article scientifique publié, il convient de le signaler en indiquant « DOI » (c’est-à-dire l’identifiant d’objet numérique) pour ResultAnalyticalMethodContext, et le DOI lui-même de la publication (par exemple, https://doi.org/10.25976/ty8w-fv) pour ResultAnalyticalMethodID.
Tableau 3 : Format pour rendre compte des méthodes décrites dans une publication scientifique
ResultAnalytical MethodID | ResultAnalytical MethodContext | ResultAnalytical MethodName | LaboratoryName |
---|---|---|---|
https://doi.org/XXXX/XXXXX | DOI (Identificateur d’objet numérique) | [nom de la méthode] | [nom du laboratoire] |
Diffuseur de la méthode inconnu
Lorsque le diffuseur et/ou les codes de la méthode ne sont pas disponibles, ResultAnalyticalMethodName doit indiquer le nom ou la description de la méthode utilisée ou fournir une référence pour le protocole. Ce champ peut également être utilisé pour saisir des informations sur l’instrument utilisé pour l’analyse (par exemple, ICP-MS, ICP-OES) ou sur la méthode analytique.
Valeurs calculées
Lorsqu’un échantillon de laboratoire est calculé, DataStream exige que les champs de la méthode analytique soient remplis. Dans ce cas, si aucun détail de calcul n’est fourni, nous recommandons de remplir ResultAnalyticalMethodName par « Calculated ». Si des détails sur les calculs sont fournis, une description détaillée dans le champ ResultAnalyticalMethodName est recommandée. Si le calcul est cité en référence ou résumé dans une revue à comité de lecture, le « DOI » de ResultAnalyticalMethodContext peut être utilisé avec le numéro DOI figurant dans ResultAnalyticalMethodID
Codes contextuels de la méthode
Si vous ne voyez pas de ResultAnalyticalMethodContext approprié pour votre jeu de données, dites-le nous, et nous pourrons l’ajouter à la liste.
Tableau 4 : Valeurs autorisées pour ResultAnalyticalMethodContext
ResultAnalytical MethodContext | Description | Exemple ResultAnalyticalMethodID |
---|---|---|
APHA | American Public Health Association Équivalent de SM (« Standard Methods ») | 3125B |
APHA_SM20ED APHA_SM21ED APHA_SM22ED APHA_SM23ED | Éditions précédentes de APHA (par exemple APHA_SM20ED est la 20e édition, etc.) https://www.standardmethods.org/ Remarque, si l’édition est inconnue, vous pouvez utiliser « APHA » pour ResultAnalyticalMethodContext | 3125B |
ASTM | D3867 | |
DOI | Identifiant d’objet numérique ResultAnalyticalMethodID doit être un URL renvoyant à une publication qui décrit la méthode. | https://doi.org/XXXX/XXXXX |
DIN | German Institute for Standardization (Institut allemand des normes) | 4500N |
EN | Normes européennes | TKN-F-ED |
ENV/CANADA | Environnement et changement climatique Canada Remarque, à utiliser seulement lorsqu’un code VMV n’est pas disponible (voir ci-dessous) | 1SRM-1 |
ENVIROLOGIX | EP 002 | |
HACH | 8048 | |
IDEXX | Quanti-Tray/2000 | |
ISO | 5663:1984 | |
LACHAT | 10-107-04-1-A | |
LaMOTTE | 5858-01 | |
MICROLOGY LABS | COLISCAN MF | |
ON MECP | Ministère de l’Environnement, de la Protection de la nature et des Parcs | E3364 |
PALINTEST LTD | LUM050 | |
PROPRIETARY | Code de méthodologie personnalisé spécifique au laboratoire d’analyse | |
Seal | Remarque - de nombreuses méthodes ont des codes équivalents à ceux de USEPA ou de ISO. | G-148-95 |
THERMO-SCIENTIFIC | AQ3010 | |
USEPA | 200.8 | |
VMV | Variable de méthode valide Codes normalisés canadiens spécifiques à chaque combinaison méthode-variable | 100802 |
YSI | Un ResultAnalyticalMethodID n’est pas nécessaire pour accompagner ResultAnalyticalMethodContext « YSI ». |
Ce guide a été préparé en collaboration avec le Dr. Megan Thompson de Thompson Aquatic Consulting.
Schématisations des paramètres de laboratoire de DataStream
Les laboratoires ont différentes façons de signaler les résultats d’analyses d’échantillons à leurs clients. DataStream collabore avec de nombreux laboratoires partout au Canada pour aider les groupes de surveillance à formater les données.
Autres ressources
Nos spécialistes des données peuvent travailler avec vous pour s’assurer que les données et les métadonnées fournies par votre laboratoire soient incluses correctement dans votre ensemble de données. Cela évitera des problèmes lors du téléversement et garantira que les données sur l’eau soient rapportées de manière cohérante (voir Structure des données).
Contactez-nous si vous travaillez avec un laboratoire et voulez établir une correspondance de paramètres, ou avez besoin d’aide pour formater vos données.